در حال حاضر پژوهشكده داراي سه گروه تخصصي زير است كه امكان اضافه شدن گروههاي ديگر نيز وجود دارد.
1- گروه سيستم هاي فناوري اطلاعات 2- گروه شبكه و امنيت اطلاعات 3- گروه تجهيزات فناوري اطلاعات